露西生来就与常人有异,她头上长着两个犄角,生有四只隐形的手,体内蕴藏着巨大的力量,人们管她这样的孩子叫作异种人。从小就被人抛弃排挤的露西一直非常孤独,直到她遇到浩太才渡过了非常愉快的几天。然而随着体内载体的呼唤,她渐渐还是显露出杀人魔的本性,并被研究所拘捕监禁。 八年后,露西从研究所里逃出来,却由于脑部重创失忆,成为“白痴少女”。此时的浩太也由于儿时的重大打击选择性失忆,两人再次相遇,浩太把露西当作陌生人收留下来。穿插着两人断断续续的回忆,故事渐渐走向了两个极端。
作品主要围绕犀川研究室成员之一的犀川创平,以及犀川的恩师的女儿西之园萌绘两人展开,虽然萌绘并不是犀川研究室的成员,但参与了该研究室此次的研讨旅行,地点定在了妃真加岛。随后,在萌绘的提议下,犀川和萌绘前去拜访了座落在这座岛上的真贺田研究所,然而他们在那里的密室中发现了一具尸体。以此为契机,之后又连续发生杀人事件,被卷入其中的两人一同解决充满谜团的连环凶杀案……
故事发生在名为恩典农场的孤儿院内,在这里生活着很多失去了亲人,无家可归的孩子们,他们共有36人,每天,在劳作和玩耍之余,孩子们还要进行学习和测验,其中,佼佼者是名为艾玛(诸星堇配音)的女孩和名为诺曼(内田真礼配音)的男孩。负责管理和看护这些孩子们的女性名叫伊莎贝拉(甲斐田裕子配音),孩子们喜欢喊她“妈妈”。每过一段时间,都会有一个孩子被收养离开农场,生活在这里的孩子们都将此作为自己的人生目标。一次偶然中,艾玛发现了隐藏在这座孤儿院背后的秘密,那些离开的孩子根本就没有被领养,而是被屠宰了,生活在恩典农场的孩
——自由,是何等美丽,又是何等残酷呢逃离了恩典农场的15个孩子。抛弃虚假的乐园、追求自由的他们,面临的是从未见过的植物和动物,以及追赶而来的“鬼”……外面的世界虽然美丽,但他们所面对的又过于残酷。但孩子们不会放弃。他们在来自“密涅瓦”的信息以及诺曼留下的一支钢笔的引导下,向着明天进发。为了实现前去迎接留在农场的“家人”这一约定。
让我们互相帮助,努力成为完美的小市民吧。」 过去因为进行称为「侦探」的推理活动,经历痛苦回忆的小鸠,下定决心要当一个低调不起眼的小市民。 他与志同道合的同学小佐内私底下结成「互惠关系」,打算在高中营造小市民的形象,度过安稳的生活, 但是不知为何,神秘的事件和灾难总是接二连三降临到他们的校园生活中。